Sebagai komitmen dalam menjaga kelestarian lingkungan khususnya pada wilayah konservasi yang dijalankan di lokasi Ekowisata Mangrove Pangkal Babu, AFT Sultan Thaha selalu berupaya agar terdapat peningkatan flora dan fauna setiap tahunnya untuk mencegah tingkat kepunahan. Adapun status keanekaragaman hayati yang dikonservasi oleh AFT Sultan Thaha dapat dilihat pada tabel berikut.